一、粉碎方式的不同
流化床氣流粉碎機是物料在高壓氣流的帶動下在4個或3個噴嘴連線交匯處通過物料自身碰撞而實現粉碎，因不與其它物料碰撞，故不存在物料污染等現象。同時對于硬度偏高的物料同樣粉碎效果較好，不影響設備壽命。
圓盤式氣流粉碎機是物料通過氣流直接撞擊在為粉碎室的內壁上，碰撞實現粉碎，故此粉碎過程對于粉碎腔體內壁的內襯存在磨損現象，物料存在被污染的可能，同時內襯需要定期更換，備件費用較高。
二、碰嘴布置的方式不同
流化床氣流粉碎機的噴嘴垂直于粉碎腔體，而圓盤式氣流粉碎機粉碎噴嘴切線于粉碎室。
三、控制粒度的方式不同
流化床氣流粉碎機通過調節分級輪高速旋轉速度控制粒度，粒度精度控制較好；而圓盤式氣流粉碎機僅通過調節加料速度來調節，粒徑不易控制。
四、系統風壓不同
流化床氣流粉碎機整個粉碎過程為負壓過程，系統后面的引風機需要高壓型，整 個粉碎過程無粉塵泄露，不污染生產環境。而圓盤式氣流粉碎機為正壓型，對引風機要求不高，甚至可以不用引風機和除塵器，粉碎過程易造成粉塵泄露，生產環境極易被污染。
五、控制柜做法不同，成本不同
因流化床氣流粉碎機通過調節分級輪高速旋轉控制粒度，所以其需要變頻器來控制，所以成本相對很高。而圓盤式氣流粉碎機，對控制要求不高，只是對系統中其他如卸料閥或除塵器控制，相對成本也很低。
六、成品粒度分布狀態不同
相對于扁平式氣流粉碎機而言，流化床式氣流粉碎機的粉碎粒徑分布范圍更窄，粒徑的均勻性更好。
由上可以看出，流化床氣流粉碎機的性能是明顯優于扁平式氣流粉碎機的，但是因其組成部件不同，流化床氣流粉碎機的設備造價一般也是高于扁平式氣流粉碎機的。對于粉碎細度要求高、純度要求高的物料，建議使用流化床氣流粉碎機。
